Metabolomics should be deployed in the identification and characterization of gene-edited crops

Verfahren wie die Kernspinresonanz (Nuclear Magnetic Resonance, NMR) und die Gas- oder Flüssigkeitsmassenspektrometrie erlauben es Veränderungen im Stoffwechsel von pflanzlichen Zellen nachzuweisen. Der Sammelbegriff dieser Verfahren lautet Metabolomics. Metabolomics Verfahren werden wiederum zusammen mit den Genomics (Analyseverfahren, um die gesamte DNA-Sequenz zu untersuchen), Transcriptomics (Analyseverfahren der gesamte RNA) und den Proteomics (Analyseverfahren aller Proteine einer Zelle) unter dem Begriff omics zusammengefasst.
In diesem Review wird die Empfehlung ausgesprochen Metabolomics-Verfahren weiterzuentwickeln und zu verbessern, um diese zur Identifizierung von genom-editierten Pflanzen einzusetzen. Mit Genome Editing können Eingriffe im Erbgut herbeigeführt werden, die vielfältige Auswirkungen auf den Stoffwechsel haben. Solche Veränderungen im Stoffwechsel der Pflanzen können beispielsweise bewirken, dass von einem bestimmten Stoffwechselprodukt weniger gebildet wird. Das kann dazu genutzt werden um genom-editierte Pflanzen von den Ursprungspflanzen (also unveränderten Pflanzen) zu unterscheiden. Dazu müssen zukünftig sowohl die Metabolomics-Verfahren weiterentwickelt als auch bioinformatische Analysetools erweitert werden, um Daten aus den verschiedenen omics-Verfahren zusammenzubringen und so verlässliche Aussagen treffen zu können.

Fraser, P.D. et al. (2020) Metabolomics should be deployed in the identification and characterization of gene-edited crops. Plant J.